Verschließt ein Gallenstein den Hauptgallengang vollständig, kann die Gallenflüssigkeit nicht mehr in den Darm fließen und staut sich auf. Als Folge hiervon entwickelt sich eine Gelbsucht (Ikterus), der Urin färbt sich dunkel, der Stuhl wird hell und Haut und Augapfel des Betroffenen färben sich gelb. Durch den Rückstau kann sich der Gallengang unter Umständen sogar entzünden (Cholangitis). Dann kommen zu den starken Schmerzen im Oberbauch auch noch Fieber und Schüttelfrost hinzu.

Auch ohne jemals eine Gallenkolik verursacht zu haben, können Gallensteine eine Entzündung der Gallenblase (Cholezystitis) hervorrufen. Durch die ständige mechanische Reizung, verkalkt die Gallenblasenwand und wird unelastisch. Aufgrund ihres Kalkgehaltes ist sie im Röntgenbild sichtbar („Porzellangallenblase"). Eine „Porzellangallenblase" erhöht das Risiko für ein Gallenblasenkarzinom. Wenn die Gallenblase ihre Elastizität verliert, kann sie sich nicht mehr vollständig zusammenziehen und kann damit ihre Funktion nicht mehr erfüllen.

Da der Gallengang und die Bauchspeicheldrüse (Pankreas) oft gemeinsam in den Zwölffingerdarm münden, kann ein Gallenstein bei extrem ungünstiger Position auch das Sekret der Bauchspeicheldrüse aufstauen und so zu einer Pankreasentzündung führen.

In sehr seltenen Fällen durchbohren Gallensteine die Gallenblasenwand. Wenn der Gallenblaseninhalt in den Bauchraum gelangt, hat das unweigerlich eine Entzündung des Bauchfells zur Folge („gallige Peritonitis").